來自瑞士蘇黎世大學、蘇黎世聯(lián)邦理工學院以及比利時根特大學的科學家合作開發(fā)出一種創(chuàng)新的基因編輯方法,將先進的“基因魔剪”技術與人工智能(AI)相結合,顯著提升了DNA編輯的精確度。這項技術為更真實地模擬人類疾病機制提供了有力工具,也為未來精準基因療法的發(fā)展奠定了基礎。
目前,確!盎蚰Ъ簟痹谇懈钅繕薉NA時不引發(fā)意外的基因變異,并維持基因組整體穩(wěn)定性,是實現(xiàn)安全治療的關鍵。雖然細胞通常能準確修復DNA雙鏈斷裂,但其修復機制尤其是末端連接過程,有時會導致插入、缺失或其他遺傳錯誤,從而帶來潛在風險。
此次,研究團隊開發(fā)出一種名為“Pythia”的AI工具。這一工具使科學家能以前所未有的精度“預知”基因編輯的最終結果,尤其是預測細胞在受到CRISPR/Cas9等基因編輯技術切割后,將如何修復其DNA斷裂。基于這一預測能力,團隊又設計出極小的DNA修復模板,這些模板如同“分子膠水”,可引導細胞以高度精確的方式完成基因修改或基因插入。
該技術的主要開發(fā)者介紹稱,這些由AI指導設計的修復模板,首先在人類細胞培養(yǎng)體系中進行了驗證,實現(xiàn)了高效且精準的基因編輯和外源基因整合。隨后,團隊進一步在多種生物模型中測試了該方法的有效性,包括非洲爪蟾以及活體小鼠,成功實現(xiàn)了對大腦等非分裂組織中細胞的DNA編輯。
DNA的修復過程并非隨機,而是遵循一定的規(guī)律。Pythia正是利用了這些可被識別和學習的修復模式。這項技術不僅可用于修改單個堿基或插入外源基因,還能用于標記特定蛋白質,例如通過熒光標記,實現(xiàn)對蛋白質在健康與疾病組織中動態(tài)行為的直接觀察。而其強大之處更在于其普適性——它適用于各種類型的細胞,包括那些不常分裂的細胞,如神經(jīng)元,這為治療神經(jīng)系統(tǒng)疾病等難以靶向的病癥帶來了新希望。
研究團隊表示,就像氣象學家使用AI預測天氣一樣,人們現(xiàn)在也能預測細胞對基因干預的響應。這種預測能力對于實現(xiàn)安全、可靠并具有臨床應用價值的基因編輯至關重要。
【總編輯圈點】
基因編輯雖好,但也會帶來不可預知的“翻車”風險。有時一“剪刀”下去,細胞在修復DNA斷裂時卻出現(xiàn)基因表達錯誤。此次,研究團隊開發(fā)出一種強大的預測型AI工具,能預測細胞遇到基因剪刀后會如何進行修復;陬A測結果,團隊設計出一種DNA修復模板,它能引導細胞進行精確基因修改。這一AI工具大大降低了基因編輯中產(chǎn)生意外錯誤的風險,避免脫靶效應,提升了治療安全性;它還能標記特定蛋白質,為難治性疾病提供治療新方案。